Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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MMP19Q99542 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms