Protein–RNA interactions for Protein: Q96RG2

PASK, PAS domain-containing serine/threonine-protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PASKQ96RG2 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PASKQ96RG2 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PASKQ96RG2 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PASKQ96RG2 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PASKQ96RG2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PASKQ96RG2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PASKQ96RG2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PASKQ96RG2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PASKQ96RG2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PASKQ96RG2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PASKQ96RG2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PASKQ96RG2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PASKQ96RG2 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PASKQ96RG2 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PASKQ96RG2 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PASKQ96RG2 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PASKQ96RG2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PASKQ96RG2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PASKQ96RG2 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PASKQ96RG2 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PASKQ96RG2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PASKQ96RG2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PASKQ96RG2 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PASKQ96RG2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PASKQ96RG2 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PASKQ96RG2 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PASKQ96RG2 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PASKQ96RG2 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PASKQ96RG2 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PASKQ96RG2 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PASKQ96RG2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PASKQ96RG2 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PASKQ96RG2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PASKQ96RG2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PASKQ96RG2 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PASKQ96RG2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PASKQ96RG2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PASKQ96RG2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PASKQ96RG2 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PASKQ96RG2 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PASKQ96RG2 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PASKQ96RG2 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PASKQ96RG2 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PASKQ96RG2 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PASKQ96RG2 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PASKQ96RG2 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PASKQ96RG2 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PASKQ96RG2 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PASKQ96RG2 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PASKQ96RG2 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PASKQ96RG2 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PASKQ96RG2 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PASKQ96RG2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PASKQ96RG2 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PASKQ96RG2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PASKQ96RG2 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PASKQ96RG2 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PASKQ96RG2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PASKQ96RG2 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PASKQ96RG2 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PASKQ96RG2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PASKQ96RG2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PASKQ96RG2 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PASKQ96RG2 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PASKQ96RG2 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PASKQ96RG2 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PASKQ96RG2 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PASKQ96RG2 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PASKQ96RG2 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PASKQ96RG2 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PASKQ96RG2 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PASKQ96RG2 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PASKQ96RG2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PASKQ96RG2 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PASKQ96RG2 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PASKQ96RG2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PASKQ96RG2 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PASKQ96RG2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PASKQ96RG2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PASKQ96RG2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PASKQ96RG2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PASKQ96RG2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PASKQ96RG2 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PASKQ96RG2 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PASKQ96RG2 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PASKQ96RG2 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PASKQ96RG2 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PASKQ96RG2 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PASKQ96RG2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PASKQ96RG2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PASKQ96RG2 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PASKQ96RG2 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PASKQ96RG2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PASKQ96RG2 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PASKQ96RG2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PASKQ96RG2 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PASKQ96RG2 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PASKQ96RG2 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PASKQ96RG2 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PASKQ96RG2 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms