Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN9

GJD4, Gap junction delta-4 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD4Q96KN9 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJD4Q96KN9 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms