Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRRIQ1Q96JM4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRRIQ1Q96JM4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRRIQ1Q96JM4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRRIQ1Q96JM4 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRRIQ1Q96JM4 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRRIQ1Q96JM4 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRRIQ1Q96JM4 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRRIQ1Q96JM4 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRRIQ1Q96JM4 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
LRRIQ1Q96JM4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRRIQ1Q96JM4 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRRIQ1Q96JM4 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRRIQ1Q96JM4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LRRIQ1Q96JM4 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LRRIQ1Q96JM4 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LRRIQ1Q96JM4 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LRRIQ1Q96JM4 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LRRIQ1Q96JM4 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LRRIQ1Q96JM4 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LRRIQ1Q96JM4 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LRRIQ1Q96JM4 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LRRIQ1Q96JM4 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LRRIQ1Q96JM4 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LRRIQ1Q96JM4 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LRRIQ1Q96JM4 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LRRIQ1Q96JM4 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
LRRIQ1Q96JM4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LRRIQ1Q96JM4 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LRRIQ1Q96JM4 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LRRIQ1Q96JM4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LRRIQ1Q96JM4 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRIQ1Q96JM4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRIQ1Q96JM4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRIQ1Q96JM4 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRIQ1Q96JM4 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRIQ1Q96JM4 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRIQ1Q96JM4 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRIQ1Q96JM4 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRIQ1Q96JM4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRIQ1Q96JM4 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRIQ1Q96JM4 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRIQ1Q96JM4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRIQ1Q96JM4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRIQ1Q96JM4 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRIQ1Q96JM4 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRIQ1Q96JM4 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRIQ1Q96JM4 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRIQ1Q96JM4 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRIQ1Q96JM4 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRIQ1Q96JM4 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRIQ1Q96JM4 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRIQ1Q96JM4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRIQ1Q96JM4 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRIQ1Q96JM4 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRRIQ1Q96JM4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRRIQ1Q96JM4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRRIQ1Q96JM4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRRIQ1Q96JM4 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRRIQ1Q96JM4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRRIQ1Q96JM4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRRIQ1Q96JM4 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
LRRIQ1Q96JM4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRRIQ1Q96JM4 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRRIQ1Q96JM4 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
LRRIQ1Q96JM4 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRRIQ1Q96JM4 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
LRRIQ1Q96JM4 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRRIQ1Q96JM4 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRRIQ1Q96JM4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRRIQ1Q96JM4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRRIQ1Q96JM4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRRIQ1Q96JM4 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
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