Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRUQ92729 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms