Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SFT2D1Q8WV19 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms