Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC148Q8NFR7 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
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