Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC06

ACBD4, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD4Q8NC06 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACBD4Q8NC06 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACBD4Q8NC06 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACBD4Q8NC06 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACBD4Q8NC06 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACBD4Q8NC06 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACBD4Q8NC06 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACBD4Q8NC06 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ACBD4Q8NC06 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ACBD4Q8NC06 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACBD4Q8NC06 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACBD4Q8NC06 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACBD4Q8NC06 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACBD4Q8NC06 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACBD4Q8NC06 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACBD4Q8NC06 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACBD4Q8NC06 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACBD4Q8NC06 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms