Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBW4

SLC38A9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A9Q8NBW4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A9Q8NBW4 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms