Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC82Q8N4S0 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms