Protein–RNA interactions for Protein: Q8N271

PROM2, Prominin-2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM2Q8N271 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PROM2Q8N271 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PROM2Q8N271 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms