Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms