Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB4

SLC9A9, Sodium/hydrogen exchanger 9, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A9Q8IVB4 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC9A9Q8IVB4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC9A9Q8IVB4 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC9A9Q8IVB4 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC9A9Q8IVB4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC9A9Q8IVB4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC9A9Q8IVB4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC9A9Q8IVB4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC9A9Q8IVB4 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC9A9Q8IVB4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC9A9Q8IVB4 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC9A9Q8IVB4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC9A9Q8IVB4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC9A9Q8IVB4 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC9A9Q8IVB4 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC9A9Q8IVB4 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC9A9Q8IVB4 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC9A9Q8IVB4 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC9A9Q8IVB4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC9A9Q8IVB4 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC9A9Q8IVB4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC9A9Q8IVB4 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC9A9Q8IVB4 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC9A9Q8IVB4 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC9A9Q8IVB4 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC9A9Q8IVB4 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC9A9Q8IVB4 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC9A9Q8IVB4 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC9A9Q8IVB4 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC9A9Q8IVB4 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC9A9Q8IVB4 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC9A9Q8IVB4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC9A9Q8IVB4 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC9A9Q8IVB4 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC9A9Q8IVB4 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC9A9Q8IVB4 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC9A9Q8IVB4 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC9A9Q8IVB4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC9A9Q8IVB4 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC9A9Q8IVB4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC9A9Q8IVB4 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC9A9Q8IVB4 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC9A9Q8IVB4 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC9A9Q8IVB4 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC9A9Q8IVB4 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC9A9Q8IVB4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC9A9Q8IVB4 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC9A9Q8IVB4 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC9A9Q8IVB4 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC9A9Q8IVB4 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC9A9Q8IVB4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC9A9Q8IVB4 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC9A9Q8IVB4 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC9A9Q8IVB4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC9A9Q8IVB4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC9A9Q8IVB4 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC9A9Q8IVB4 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC9A9Q8IVB4 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC9A9Q8IVB4 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC9A9Q8IVB4 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC9A9Q8IVB4 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC9A9Q8IVB4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC9A9Q8IVB4 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC9A9Q8IVB4 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC9A9Q8IVB4 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC9A9Q8IVB4 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC9A9Q8IVB4 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC9A9Q8IVB4 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC9A9Q8IVB4 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC9A9Q8IVB4 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC9A9Q8IVB4 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC9A9Q8IVB4 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC9A9Q8IVB4 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC9A9Q8IVB4 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC9A9Q8IVB4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC9A9Q8IVB4 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC9A9Q8IVB4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC9A9Q8IVB4 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC9A9Q8IVB4 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC9A9Q8IVB4 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC9A9Q8IVB4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC9A9Q8IVB4 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC9A9Q8IVB4 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC9A9Q8IVB4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC9A9Q8IVB4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC9A9Q8IVB4 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC9A9Q8IVB4 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC9A9Q8IVB4 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC9A9Q8IVB4 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC9A9Q8IVB4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC9A9Q8IVB4 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC9A9Q8IVB4 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC9A9Q8IVB4 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC9A9Q8IVB4 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC9A9Q8IVB4 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC9A9Q8IVB4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC9A9Q8IVB4 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC9A9Q8IVB4 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC9A9Q8IVB4 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC9A9Q8IVB4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms