Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC84Q86UT8 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms