Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
STRCQ7RTU9 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms