Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms