Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms