Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms