Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms