Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD62

CTR9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTR9Q6PD62 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTR9Q6PD62 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms