Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF123Q5XPI4 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms