Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CARMIL1Q5VZK9 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
CARMIL1Q5VZK9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
CARMIL1Q5VZK9 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
CARMIL1Q5VZK9 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
CARMIL1Q5VZK9 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CARMIL1Q5VZK9 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CARMIL1Q5VZK9 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CARMIL1Q5VZK9 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CARMIL1Q5VZK9 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CARMIL1Q5VZK9 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms