Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Q5VSD8 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q5VSD8 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q5VSD8 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q5VSD8 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Q5VSD8 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Q5VSD8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q5VSD8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q5VSD8 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q5VSD8 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q5VSD8 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q5VSD8 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q5VSD8 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Q5VSD8 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Q5VSD8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q5VSD8 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q5VSD8 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q5VSD8 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q5VSD8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q5VSD8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q5VSD8 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q5VSD8 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q5VSD8 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q5VSD8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q5VSD8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q5VSD8 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q5VSD8 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q5VSD8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q5VSD8 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q5VSD8 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q5VSD8 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q5VSD8 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q5VSD8 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q5VSD8 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q5VSD8 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q5VSD8 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q5VSD8 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Q5VSD8 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q5VSD8 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q5VSD8 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q5VSD8 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q5VSD8 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q5VSD8 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q5VSD8 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q5VSD8 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q5VSD8 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q5VSD8 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Q5VSD8 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q5VSD8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q5VSD8 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q5VSD8 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q5VSD8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q5VSD8 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q5VSD8 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q5VSD8 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q5VSD8 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q5VSD8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q5VSD8 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q5VSD8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q5VSD8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q5VSD8 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q5VSD8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q5VSD8 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Q5VSD8 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Q5VSD8 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q5VSD8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q5VSD8 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q5VSD8 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q5VSD8 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q5VSD8 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q5VSD8 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Q5VSD8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q5VSD8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q5VSD8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q5VSD8 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q5VSD8 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q5VSD8 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q5VSD8 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q5VSD8 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q5VSD8 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q5VSD8 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q5VSD8 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q5VSD8 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Q5VSD8 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q5VSD8 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q5VSD8 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q5VSD8 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Q5VSD8 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Q5VSD8 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Q5VSD8 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q5VSD8 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Q5VSD8 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Q5VSD8 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q5VSD8 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q5VSD8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q5VSD8 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q5VSD8 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q5VSD8 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q5VSD8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q5VSD8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms