Protein–RNA interactions for Protein: Q5TIE3

VWA5B1, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B1, humanhuman

Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA5B1Q5TIE3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VWA5B1Q5TIE3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms