Protein–RNA interactions for Protein: Q5T619

ZNF648, Zinc finger protein 648, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF648Q5T619 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF648Q5T619 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF648Q5T619 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF648Q5T619 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF648Q5T619 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF648Q5T619 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF648Q5T619 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF648Q5T619 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF648Q5T619 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF648Q5T619 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF648Q5T619 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF648Q5T619 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF648Q5T619 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF648Q5T619 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF648Q5T619 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF648Q5T619 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF648Q5T619 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF648Q5T619 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF648Q5T619 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF648Q5T619 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ZNF648Q5T619 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ZNF648Q5T619 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ZNF648Q5T619 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ZNF648Q5T619 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ZNF648Q5T619 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF648Q5T619 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF648Q5T619 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF648Q5T619 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF648Q5T619 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF648Q5T619 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF648Q5T619 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF648Q5T619 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF648Q5T619 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF648Q5T619 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF648Q5T619 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF648Q5T619 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF648Q5T619 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF648Q5T619 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF648Q5T619 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF648Q5T619 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF648Q5T619 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF648Q5T619 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF648Q5T619 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF648Q5T619 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF648Q5T619 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF648Q5T619 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF648Q5T619 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF648Q5T619 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF648Q5T619 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF648Q5T619 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF648Q5T619 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF648Q5T619 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF648Q5T619 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF648Q5T619 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF648Q5T619 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF648Q5T619 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF648Q5T619 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF648Q5T619 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF648Q5T619 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF648Q5T619 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF648Q5T619 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF648Q5T619 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF648Q5T619 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF648Q5T619 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF648Q5T619 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF648Q5T619 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF648Q5T619 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF648Q5T619 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF648Q5T619 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF648Q5T619 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF648Q5T619 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF648Q5T619 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF648Q5T619 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF648Q5T619 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF648Q5T619 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF648Q5T619 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF648Q5T619 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF648Q5T619 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF648Q5T619 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF648Q5T619 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF648Q5T619 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF648Q5T619 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF648Q5T619 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF648Q5T619 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF648Q5T619 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF648Q5T619 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF648Q5T619 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF648Q5T619 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF648Q5T619 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF648Q5T619 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF648Q5T619 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF648Q5T619 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF648Q5T619 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF648Q5T619 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF648Q5T619 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF648Q5T619 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF648Q5T619 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF648Q5T619 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF648Q5T619 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF648Q5T619 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms