Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LDLRAP1Q5SW96 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms