Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms