Protein–RNA interactions for Protein: Q29RF7

PDS5A, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDS5AQ29RF7 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms