Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
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