Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CHRNA2Q15822 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRNA2Q15822 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
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