Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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