Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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SPIDRQ14159 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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SPIDRQ14159 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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SPIDRQ14159 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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SPIDRQ14159 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPIDRQ14159 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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