Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CDK13Q14004 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
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