Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEUROD1Q13562 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms