Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 AC010422.1-201ENST00000414548 543 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 AC022762.2-201ENST00000600308 1353 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MKRN4PQ13434 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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