Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
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