Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHAF1AQ13111 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
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