Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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