Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPN13Q12923 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPN13Q12923 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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