Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 GIGYF2-212ENST00000425040 588 ntTSL 46.67□□□□□ -1.342e-6■■■□□ 15.6
ILF3Q12906 GIGYF2-226ENST00000464402 529 ntTSL 46.67□□□□□ -1.342e-6■■■□□ 15.6
ILF3Q12906 GIGYF2-242ENST00000489328 1116 ntTSL 55.55□□□□□ -1.522e-6■■■□□ 15.6
ILF3Q12906 GIGYF2-244ENST00000490612 567 ntTSL 45.55□□□□□ -1.522e-6■■■□□ 15.6
ILF3Q12906 GIGYF2-245ENST00000492910 685 ntTSL 25.55□□□□□ -1.522e-6■■■□□ 15.6
ILF3Q12906 GIGYF2-207ENST00000421433 564 ntTSL 55.46□□□□□ -1.542e-6■■■□□ 15.6
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ILF3Q12906 GIGYF2-240ENST00000488629 562 ntTSL 44.75□□□□□ -1.652e-6■■■□□ 15.6
ILF3Q12906 GIGYF2-233ENST00000475359 825 ntTSL 24.52□□□□□ -1.692e-6■■■□□ 15.6
ILF3Q12906 GIGYF2-238ENST00000483164 577 ntTSL 54.52□□□□□ -1.692e-6■■■□□ 15.6
ILF3Q12906 GIGYF2-241ENST00000488734 796 ntTSL 34.35□□□□□ -1.712e-6■■■□□ 15.6
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ILF3Q12906 UBE2K-206ENST00000510934 589 ntTSL 220.22■□□□□ 0.838e-7■■■□□ 15.6
ILF3Q12906 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.758e-7■■■□□ 15.6
ILF3Q12906 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.728e-7■■■□□ 15.6
ILF3Q12906 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.518e-7■■■□□ 15.6
ILF3Q12906 UBE2K-202ENST00000438068 2262 ntTSL 217.45■□□□□ 0.388e-7■■■□□ 15.6
ILF3Q12906 UBE2K-205ENST00000510719 566 ntTSL 38.72□□□□□ -1.018e-7■■■□□ 15.6
ILF3Q12906 PCBP2-222ENST00000552296 1342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.994e-13■■■□□ 15.6
ILF3Q12906 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.156e-7■■■□□ 15.6
ILF3Q12906 ABCC6-202ENST00000456970 4137 ntTSL 213.53□□□□□ -0.246e-7■■■□□ 15.6
ILF3Q12906 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.266e-7■■■□□ 15.6
ILF3Q12906 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.137e-6■■■□□ 15.6
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ILF3Q12906 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.082e-6■■■□□ 15.6
ILF3Q12906 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.062e-6■■■□□ 15.6
ILF3Q12906 NIPSNAP2-210ENST00000487370 494 ntTSL 320.62■□□□□ 0.892e-6■■■□□ 15.6
ILF3Q12906 NIPSNAP2-203ENST00000437587 818 ntTSL 519.68■□□□□ 0.742e-6■■■□□ 15.6
ILF3Q12906 NIPSNAP2-208ENST00000470036 497 ntTSL 219.47■□□□□ 0.712e-6■■■□□ 15.6
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ILF3Q12906 NIPSNAP2-209ENST00000472404 250 ntTSL 50.98□□□□□ -2.252e-6■■■□□ 15.6
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ILF3Q12906 ANKRD11-215ENST00000568512 294 ntTSL 28.75□□□□□ -1.012e-7■■■□□ 15.6
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ILF3Q12906 CSE1L-201ENST00000262982 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.712e-9■■■□□ 15.5
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ILF3Q12906 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.982e-6■■■□□ 15.5
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ILF3Q12906 CTNNA1-237ENST00000523275 536 ntTSL 511.75□□□□□ -0.531e-8■■■□□ 15.5
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ILF3Q12906 CTNNA1-230ENST00000521724 2741 ntTSL 28.82□□□□□ -11e-8■■■□□ 15.5
ILF3Q12906 CTNNA1-203ENST00000517534 416 ntTSL 28.33□□□□□ -1.081e-8■■■□□ 15.5
ILF3Q12906 CDYL-204ENST00000440139 690 ntTSL 38.26□□□□□ -1.092e-6■■■□□ 15.5
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ILF3Q12906 CTNNA1-244ENST00000627109 3831 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.361e-8■■■□□ 15.5
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ILF3Q12906 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.961e-6■■■□□ 15.5
ILF3Q12906 TOP3A-218ENST00000584669 580 ntTSL 420.56■□□□□ 0.884e-6■■■□□ 15.5
ILF3Q12906 TOP3A-202ENST00000461127 823 ntTSL 317.27■□□□□ 0.364e-6■■■□□ 15.5
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ILF3Q12906 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.824e-8■■■□□ 15.5
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ILF3Q12906 RAB10-201ENST00000264710 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.515e-7■■■□□ 15.5
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ILF3Q12906 XIAP-208ENST00000481776 598 ntTSL 515.22■□□□□ 0.036e-7■■■□□ 15.5
ILF3Q12906 LRP8-212ENST00000529670 660 ntTSL 54.96□□□□□ -1.621e-6■■■□□ 15.5
ILF3Q12906 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.24e-6■■■□□ 15.5
ILF3Q12906 MAPK6-203ENST00000558100 514 ntTSL 213.31□□□□□ -0.284e-6■■■□□ 15.5
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ILF3Q12906 MAPK6-204ENST00000558841 656 ntTSL 29.15□□□□□ -0.944e-6■■■□□ 15.5
ILF3Q12906 MAPK6-201ENST00000261845 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.264e-6■■■□□ 15.5
ILF3Q12906 MAPK6-208ENST00000560802 552 ntTSL 46.29□□□□□ -1.44e-6■■■□□ 15.5
ILF3Q12906 MAPK6-205ENST00000558891 583 ntTSL 34.38□□□□□ -1.714e-6■■■□□ 15.5
ILF3Q12906 MAPK6-202ENST00000558063 583 ntTSL 43.23□□□□□ -1.894e-6■■■□□ 15.5
ILF3Q12906 MAPK6-206ENST00000560254 574 ntTSL 42.97□□□□□ -1.934e-6■■■□□ 15.5
ILF3Q12906 VWDE-203ENST00000452576 5936 ntTSL 1 (best)12.02□□□□□ -0.484e-7■■■□□ 15.5
ILF3Q12906 VWDE-201ENST00000275358 5260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.494e-7■■■□□ 15.5
ILF3Q12906 VWDE-206ENST00000614403 4701 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.624e-7■■■□□ 15.5
ILF3Q12906 VWDE-205ENST00000521169 4700 ntTSL 511.15□□□□□ -0.624e-7■■■□□ 15.5
ILF3Q12906 DENND5B-206ENST00000545147 566 ntTSL 222.74■■□□□ 1.231e-9■■■□□ 15.5
ILF3Q12906 DENND5B-205ENST00000544698 643 ntTSL 321.61■■□□□ 1.051e-9■■■□□ 15.5
ILF3Q12906 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.141e-9■■■□□ 15.5
ILF3Q12906 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 01e-9■■■□□ 15.5
ILF3Q12906 DENND5B-203ENST00000536562 4291 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.761e-9■■■□□ 15.5
ILF3Q12906 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.383e-7■■■□□ 15.5
ILF3Q12906 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.023e-7■■■□□ 15.5
ILF3Q12906 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.183e-7■■■□□ 15.5
ILF3Q12906 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.493e-7■■■□□ 15.5
ILF3Q12906 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.63e-7■■■□□ 15.5
ILF3Q12906 CCDC84-205ENST00000528088 1482 ntTSL 210.87□□□□□ -0.671e-11■■■□□ 15.4
ILF3Q12906 HELZ-204ENST00000578938 660 ntTSL 39.86□□□□□ -0.832e-6■■■□□ 15.4
ILF3Q12906 HELZ-202ENST00000417253 1872 ntTSL 57.21□□□□□ -1.252e-6■■■□□ 15.4
ILF3Q12906 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.422e-6■■■□□ 15.4
ILF3Q12906 HELZ-206ENST00000579953 6365 ntTSL 26.08□□□□□ -1.442e-6■■■□□ 15.4
ILF3Q12906 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.852e-6■■■□□ 15.4
ILF3Q12906 HELZ-203ENST00000578783 577 ntTSL 33.09□□□□□ -1.912e-6■■■□□ 15.4
ILF3Q12906 TRIM26-264ENST00000418026 603 ntTSL 221.37■■□□□ 1.014e-6■■■□□ 15.4
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