Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
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GTF3C1Q12789 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
GTF3C1Q12789 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF3C1Q12789 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF3C1Q12789 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF3C1Q12789 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF3C1Q12789 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF3C1Q12789 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF3C1Q12789 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF3C1Q12789 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF3C1Q12789 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF3C1Q12789 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF3C1Q12789 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF3C1Q12789 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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