Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PUDPQ08623 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms