Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDR1Q08345 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms