Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms