Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CALD1Q05682 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms