Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms