Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ERCC6Q03468 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ERCC6Q03468 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
ERCC6Q03468 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ERCC6Q03468 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ERCC6Q03468 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ERCC6Q03468 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ERCC6Q03468 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ERCC6Q03468 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ERCC6Q03468 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ERCC6Q03468 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ERCC6Q03468 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
ERCC6Q03468 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
ERCC6Q03468 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ERCC6Q03468 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ERCC6Q03468 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ERCC6Q03468 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ERCC6Q03468 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
ERCC6Q03468 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ERCC6Q03468 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ERCC6Q03468 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
ERCC6Q03468 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
ERCC6Q03468 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ERCC6Q03468 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
ERCC6Q03468 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ERCC6Q03468 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ERCC6Q03468 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ERCC6Q03468 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
ERCC6Q03468 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
ERCC6Q03468 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
ERCC6Q03468 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
ERCC6Q03468 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
ERCC6Q03468 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
ERCC6Q03468 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC32.39■■■□□ 2.78
ERCC6Q03468 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
ERCC6Q03468 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
ERCC6Q03468 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
ERCC6Q03468 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
ERCC6Q03468 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms