Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CYP27A1Q02318 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms