Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HSF1Q00613 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms