Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMF1P82094 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TMF1P82094 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TMF1P82094 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMF1P82094 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMF1P82094 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMF1P82094 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMF1P82094 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMF1P82094 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMF1P82094 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMF1P82094 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMF1P82094 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMF1P82094 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMF1P82094 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMF1P82094 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMF1P82094 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMF1P82094 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMF1P82094 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMF1P82094 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMF1P82094 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMF1P82094 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMF1P82094 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMF1P82094 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMF1P82094 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMF1P82094 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TMF1P82094 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMF1P82094 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMF1P82094 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMF1P82094 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMF1P82094 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMF1P82094 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TMF1P82094 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMF1P82094 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMF1P82094 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMF1P82094 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMF1P82094 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TMF1P82094 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMF1P82094 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TMF1P82094 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMF1P82094 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMF1P82094 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMF1P82094 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMF1P82094 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMF1P82094 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMF1P82094 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TMF1P82094 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TMF1P82094 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMF1P82094 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMF1P82094 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMF1P82094 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMF1P82094 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TMF1P82094 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMF1P82094 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMF1P82094 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMF1P82094 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMF1P82094 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMF1P82094 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMF1P82094 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMF1P82094 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TMF1P82094 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMF1P82094 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMF1P82094 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TMF1P82094 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMF1P82094 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMF1P82094 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMF1P82094 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMF1P82094 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMF1P82094 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMF1P82094 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMF1P82094 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMF1P82094 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMF1P82094 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMF1P82094 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TMF1P82094 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMF1P82094 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMF1P82094 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMF1P82094 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMF1P82094 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TMF1P82094 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMF1P82094 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TMF1P82094 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TMF1P82094 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TMF1P82094 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMF1P82094 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMF1P82094 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMF1P82094 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMF1P82094 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMF1P82094 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMF1P82094 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMF1P82094 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMF1P82094 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMF1P82094 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMF1P82094 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMF1P82094 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMF1P82094 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMF1P82094 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMF1P82094 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMF1P82094 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMF1P82094 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMF1P82094 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms